Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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