Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDK3Q15120 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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