Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PCOLCEQ15113 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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