Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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NCF4Q15080 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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NCF4Q15080 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCF4Q15080 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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