Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3GAP1Q15042 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
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