Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
GAPVD1Q14C86 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
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