Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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GPNMBQ14956 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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GPNMBQ14956 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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GPNMBQ14956 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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GPNMBQ14956 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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GPNMBQ14956 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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GPNMBQ14956 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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GPNMBQ14956 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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GPNMBQ14956 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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GPNMBQ14956 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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