Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD11Q14690 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDCD11Q14690 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms