Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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COL9A2Q14055 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A2Q14055 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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