Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CDK13Q14004 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK13Q14004 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
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