Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2H3Q13889 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms