Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms