Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMB3Q13751 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms