Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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