Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3B2Q13435 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3B2Q13435 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3B2Q13435 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3B2Q13435 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3B2Q13435 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3B2Q13435 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3B2Q13435 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3B2Q13435 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3B2Q13435 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3B2Q13435 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3B2Q13435 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3B2Q13435 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3B2Q13435 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3B2Q13435 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3B2Q13435 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3B2Q13435 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3B2Q13435 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3B2Q13435 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3B2Q13435 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3B2Q13435 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3B2Q13435 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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