Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MKRN4PQ13434 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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