Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRSQ13332 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRSQ13332 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms