Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DUSP4Q13115 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP4Q13115 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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