Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHAF1BQ13112 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHAF1BQ13112 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms