Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STRN3Q13033 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms