Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KIF5AQ12840 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms