Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF5Q12774 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGEF5Q12774 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms