Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDR1Q08345 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms