Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNG1Q06432 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms