Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1DQ01668 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1DQ01668 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1DQ01668 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1DQ01668 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1DQ01668 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1DQ01668 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1DQ01668 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1DQ01668 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1DQ01668 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1DQ01668 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1DQ01668 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1DQ01668 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1DQ01668 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1DQ01668 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1DQ01668 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1DQ01668 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1DQ01668 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1DQ01668 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1DQ01668 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1DQ01668 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1DQ01668 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1DQ01668 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1DQ01668 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1DQ01668 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1DQ01668 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1DQ01668 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1DQ01668 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1DQ01668 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms