Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms