Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DEFA5Q01523 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEFA5Q01523 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms