Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLTCQ00610 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms