Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDPQ00604 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDPQ00604 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDPQ00604 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDPQ00604 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDPQ00604 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDPQ00604 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDPQ00604 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDPQ00604 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDPQ00604 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDPQ00604 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDPQ00604 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDPQ00604 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDPQ00604 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDPQ00604 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDPQ00604 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDPQ00604 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDPQ00604 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDPQ00604 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDPQ00604 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDPQ00604 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDPQ00604 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms