Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKOR1P84550 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKOR1P84550 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms