Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP2P78314 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2P78314 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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