Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HBBP68871 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HBBP68871 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HBBP68871 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HBBP68871 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HBBP68871 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HBBP68871 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HBBP68871 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HBBP68871 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HBBP68871 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HBBP68871 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HBBP68871 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms