Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACTG1P63261 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms