Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS29P62273 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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