Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVPABLB-1P60509 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms