Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVFRD-1P60508 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms