Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHMP4BP1P59074 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4BP1P59074 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms