Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms