Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MTCP1P56278 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTCP1P56278 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms