Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAX9P55771 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAX9P55771 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX9P55771 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX9P55771 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX9P55771 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX9P55771 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX9P55771 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX9P55771 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX9P55771 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX9P55771 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX9P55771 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX9P55771 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX9P55771 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX9P55771 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX9P55771 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX9P55771 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX9P55771 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX9P55771 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX9P55771 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX9P55771 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX9P55771 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX9P55771 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX9P55771 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX9P55771 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX9P55771 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX9P55771 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX9P55771 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX9P55771 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms