Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELLP55199 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELLP55199 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELLP55199 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELLP55199 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELLP55199 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELLP55199 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELLP55199 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELLP55199 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELLP55199 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELLP55199 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELLP55199 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELLP55199 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELLP55199 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELLP55199 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELLP55199 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELLP55199 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELLP55199 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELLP55199 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELLP55199 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELLP55199 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELLP55199 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELLP55199 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ELLP55199 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ELLP55199 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELLP55199 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELLP55199 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELLP55199 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELLP55199 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELLP55199 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELLP55199 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELLP55199 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELLP55199 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ELLP55199 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELLP55199 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELLP55199 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELLP55199 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELLP55199 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELLP55199 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELLP55199 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELLP55199 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELLP55199 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELLP55199 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ELLP55199 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ELLP55199 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELLP55199 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELLP55199 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELLP55199 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ELLP55199 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELLP55199 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELLP55199 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELLP55199 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELLP55199 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELLP55199 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELLP55199 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELLP55199 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ELLP55199 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ELLP55199 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ELLP55199 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms