Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E1P51965 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.4 ms