Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNA2P51530 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNA2P51530 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNA2P51530 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNA2P51530 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNA2P51530 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNA2P51530 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNA2P51530 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNA2P51530 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNA2P51530 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNA2P51530 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNA2P51530 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNA2P51530 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNA2P51530 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNA2P51530 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNA2P51530 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNA2P51530 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNA2P51530 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNA2P51530 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DNA2P51530 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNA2P51530 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNA2P51530 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNA2P51530 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNA2P51530 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNA2P51530 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNA2P51530 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNA2P51530 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNA2P51530 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNA2P51530 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNA2P51530 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNA2P51530 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DNA2P51530 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNA2P51530 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNA2P51530 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNA2P51530 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNA2P51530 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNA2P51530 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNA2P51530 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNA2P51530 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DNA2P51530 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNA2P51530 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNA2P51530 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNA2P51530 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNA2P51530 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNA2P51530 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNA2P51530 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNA2P51530 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNA2P51530 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNA2P51530 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNA2P51530 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNA2P51530 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNA2P51530 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNA2P51530 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNA2P51530 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNA2P51530 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNA2P51530 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNA2P51530 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DNA2P51530 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNA2P51530 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNA2P51530 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNA2P51530 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNA2P51530 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNA2P51530 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNA2P51530 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNA2P51530 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNA2P51530 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNA2P51530 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNA2P51530 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNA2P51530 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNA2P51530 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNA2P51530 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNA2P51530 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms