Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT4P50991 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT4P50991 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT4P50991 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT4P50991 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT4P50991 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT4P50991 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT4P50991 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT4P50991 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT4P50991 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT4P50991 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT4P50991 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT4P50991 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT4P50991 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT4P50991 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT4P50991 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT4P50991 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT4P50991 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT4P50991 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT4P50991 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT4P50991 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT4P50991 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT4P50991 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT4P50991 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT4P50991 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT4P50991 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT4P50991 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT4P50991 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT4P50991 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT4P50991 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT4P50991 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT4P50991 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT4P50991 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT4P50991 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT4P50991 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT4P50991 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT4P50991 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT4P50991 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT4P50991 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT4P50991 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT4P50991 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT4P50991 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT4P50991 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT4P50991 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT4P50991 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT4P50991 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT4P50991 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT4P50991 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT4P50991 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT4P50991 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT4P50991 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT4P50991 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT4P50991 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT4P50991 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT4P50991 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT4P50991 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT4P50991 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT4P50991 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT4P50991 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT4P50991 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT4P50991 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT4P50991 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT4P50991 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT4P50991 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT4P50991 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCT4P50991 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCT4P50991 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCT4P50991 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCT4P50991 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms