Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA4P48169 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA4P48169 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms