Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RANGAP1P46060 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RANGAP1P46060 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms