Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNNT2P45379 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNT2P45379 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNT2P45379 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNT2P45379 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNT2P45379 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms