Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PBX2P40425 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PBX2P40425 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PBX2P40425 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PBX2P40425 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PBX2P40425 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PBX2P40425 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PBX2P40425 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PBX2P40425 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PBX2P40425 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PBX2P40425 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PBX2P40425 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PBX2P40425 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PBX2P40425 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PBX2P40425 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PBX2P40425 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PBX2P40425 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PBX2P40425 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PBX2P40425 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PBX2P40425 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PBX2P40425 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PBX2P40425 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PBX2P40425 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PBX2P40425 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PBX2P40425 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PBX2P40425 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PBX2P40425 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PBX2P40425 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PBX2P40425 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PBX2P40425 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PBX2P40425 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PBX2P40425 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PBX2P40425 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PBX2P40425 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PBX2P40425 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PBX2P40425 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PBX2P40425 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PBX2P40425 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PBX2P40425 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PBX2P40425 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PBX2P40425 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PBX2P40425 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PBX2P40425 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PBX2P40425 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PBX2P40425 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PBX2P40425 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PBX2P40425 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PBX2P40425 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PBX2P40425 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PBX2P40425 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PBX2P40425 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PBX2P40425 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PBX2P40425 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PBX2P40425 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PBX2P40425 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PBX2P40425 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PBX2P40425 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PBX2P40425 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PBX2P40425 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PBX2P40425 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PBX2P40425 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PBX2P40425 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PBX2P40425 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PBX2P40425 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PBX2P40425 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PBX2P40425 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PBX2P40425 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PBX2P40425 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PBX2P40425 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PBX2P40425 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBX2P40425 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBX2P40425 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBX2P40425 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PBX2P40425 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBX2P40425 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBX2P40425 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBX2P40425 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PBX2P40425 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBX2P40425 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBX2P40425 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBX2P40425 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBX2P40425 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBX2P40425 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBX2P40425 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBX2P40425 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PBX2P40425 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PBX2P40425 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBX2P40425 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBX2P40425 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBX2P40425 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBX2P40425 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBX2P40425 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBX2P40425 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBX2P40425 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBX2P40425 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PBX2P40425 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PBX2P40425 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PBX2P40425 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PBX2P40425 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PBX2P40425 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms