Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms