Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FLT4P35916 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FLT4P35916 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FLT4P35916 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FLT4P35916 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FLT4P35916 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FLT4P35916 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FLT4P35916 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FLT4P35916 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FLT4P35916 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FLT4P35916 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FLT4P35916 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLT4P35916 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLT4P35916 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLT4P35916 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLT4P35916 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLT4P35916 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLT4P35916 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLT4P35916 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLT4P35916 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLT4P35916 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLT4P35916 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLT4P35916 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLT4P35916 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLT4P35916 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLT4P35916 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLT4P35916 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLT4P35916 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLT4P35916 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FLT4P35916 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FLT4P35916 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FLT4P35916 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
FLT4P35916 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FLT4P35916 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FLT4P35916 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FLT4P35916 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FLT4P35916 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FLT4P35916 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FLT4P35916 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FLT4P35916 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FLT4P35916 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FLT4P35916 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FLT4P35916 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FLT4P35916 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FLT4P35916 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FLT4P35916 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FLT4P35916 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FLT4P35916 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FLT4P35916 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FLT4P35916 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FLT4P35916 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FLT4P35916 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FLT4P35916 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FLT4P35916 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FLT4P35916 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FLT4P35916 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FLT4P35916 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FLT4P35916 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FLT4P35916 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FLT4P35916 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FLT4P35916 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FLT4P35916 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FLT4P35916 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FLT4P35916 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FLT4P35916 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FLT4P35916 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FLT4P35916 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FLT4P35916 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FLT4P35916 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FLT4P35916 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FLT4P35916 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FLT4P35916 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FLT4P35916 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FLT4P35916 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FLT4P35916 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FLT4P35916 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FLT4P35916 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FLT4P35916 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FLT4P35916 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FLT4P35916 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FLT4P35916 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FLT4P35916 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FLT4P35916 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FLT4P35916 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FLT4P35916 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FLT4P35916 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FLT4P35916 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FLT4P35916 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FLT4P35916 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FLT4P35916 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FLT4P35916 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FLT4P35916 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FLT4P35916 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FLT4P35916 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FLT4P35916 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FLT4P35916 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FLT4P35916 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FLT4P35916 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FLT4P35916 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FLT4P35916 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms